Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ6

ZC4H2, Zinc finger C4H2 domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC4H2Q9NQZ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC4H2Q9NQZ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC4H2Q9NQZ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC4H2Q9NQZ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZC4H2Q9NQZ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZC4H2Q9NQZ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC4H2Q9NQZ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC4H2Q9NQZ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZC4H2Q9NQZ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC4H2Q9NQZ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC4H2Q9NQZ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms