Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGB3Q9NQW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGB3Q9NQW8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGB3Q9NQW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNGB3Q9NQW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGB3Q9NQW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGB3Q9NQW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGB3Q9NQW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB3Q9NQW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB3Q9NQW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB3Q9NQW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB3Q9NQW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB3Q9NQW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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