Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREM1Q9NP99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREM1Q9NP99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREM1Q9NP99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TREM1Q9NP99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREM1Q9NP99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREM1Q9NP99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM1Q9NP99 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM1Q9NP99 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREM1Q9NP99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM1Q9NP99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms