Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC24A3Q9HC58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC24A3Q9HC58 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC24A3Q9HC58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC24A3Q9HC58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A3Q9HC58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A3Q9HC58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A3Q9HC58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A3Q9HC58 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A3Q9HC58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A3Q9HC58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A3Q9HC58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A3Q9HC58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC24A3Q9HC58 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC24A3Q9HC58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms