Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POPDC2Q9HBU9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POPDC2Q9HBU9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POPDC2Q9HBU9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POPDC2Q9HBU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POPDC2Q9HBU9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POPDC2Q9HBU9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POPDC2Q9HBU9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POPDC2Q9HBU9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POPDC2Q9HBU9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POPDC2Q9HBU9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POPDC2Q9HBU9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POPDC2Q9HBU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POPDC2Q9HBU9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POPDC2Q9HBU9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POPDC2Q9HBU9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POPDC2Q9HBU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POPDC2Q9HBU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POPDC2Q9HBU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms