Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP3Q9H6Z4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RANBP3Q9H6Z4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RANBP3Q9H6Z4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANBP3Q9H6Z4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANBP3Q9H6Z4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANBP3Q9H6Z4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP3Q9H6Z4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANBP3Q9H6Z4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RANBP3Q9H6Z4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP3Q9H6Z4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP3Q9H6Z4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RANBP3Q9H6Z4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP3Q9H6Z4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms