Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLMPQ9H6B4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLMPQ9H6B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLMPQ9H6B4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLMPQ9H6B4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMPQ9H6B4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLMPQ9H6B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLMPQ9H6B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLMPQ9H6B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLMPQ9H6B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms