Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX3Q9H6A9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX3Q9H6A9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX3Q9H6A9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX3Q9H6A9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX3Q9H6A9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX3Q9H6A9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX3Q9H6A9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCNX3Q9H6A9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCNX3Q9H6A9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX3Q9H6A9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX3Q9H6A9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX3Q9H6A9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX3Q9H6A9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX3Q9H6A9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX3Q9H6A9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms