Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STN1Q9H668 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STN1Q9H668 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
STN1Q9H668 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STN1Q9H668 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STN1Q9H668 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STN1Q9H668 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STN1Q9H668 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STN1Q9H668 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STN1Q9H668 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STN1Q9H668 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STN1Q9H668 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STN1Q9H668 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
STN1Q9H668 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STN1Q9H668 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STN1Q9H668 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STN1Q9H668 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STN1Q9H668 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STN1Q9H668 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms