Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S3

TMPRSS5, Transmembrane protease serine 5, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5Q9H3S3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS5Q9H3S3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS5Q9H3S3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS5Q9H3S3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS5Q9H3S3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS5Q9H3S3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS5Q9H3S3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS5Q9H3S3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS5Q9H3S3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS5Q9H3S3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms