Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N8

HRH4, Histamine H4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH4Q9H3N8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH4Q9H3N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRH4Q9H3N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRH4Q9H3N8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRH4Q9H3N8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRH4Q9H3N8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH4Q9H3N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH4Q9H3N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HRH4Q9H3N8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRH4Q9H3N8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRH4Q9H3N8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRH4Q9H3N8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH4Q9H3N8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRH4Q9H3N8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRH4Q9H3N8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRH4Q9H3N8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HRH4Q9H3N8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HRH4Q9H3N8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms