Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCXQ9H320 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCXQ9H320 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
VCXQ9H320 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VCXQ9H320 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCXQ9H320 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCXQ9H320 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCXQ9H320 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCXQ9H320 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCXQ9H320 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCXQ9H320 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCXQ9H320 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCXQ9H320 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCXQ9H320 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCXQ9H320 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCXQ9H320 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms