Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms