Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL25Q9H0H3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL25Q9H0H3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL25Q9H0H3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL25Q9H0H3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL25Q9H0H3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL25Q9H0H3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL25Q9H0H3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL25Q9H0H3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL25Q9H0H3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms