Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRINP2Q9C0B6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRINP2Q9C0B6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRINP2Q9C0B6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRINP2Q9C0B6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRINP2Q9C0B6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRINP2Q9C0B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRINP2Q9C0B6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRINP2Q9C0B6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRINP2Q9C0B6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP2Q9C0B6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRINP2Q9C0B6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRINP2Q9C0B6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRINP2Q9C0B6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRINP2Q9C0B6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRINP2Q9C0B6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BRINP2Q9C0B6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRINP2Q9C0B6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRINP2Q9C0B6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRINP2Q9C0B6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRINP2Q9C0B6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRINP2Q9C0B6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRINP2Q9C0B6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms