Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCLK3Q9C098 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCLK3Q9C098 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCLK3Q9C098 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DCLK3Q9C098 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DCLK3Q9C098 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DCLK3Q9C098 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DCLK3Q9C098 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DCLK3Q9C098 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DCLK3Q9C098 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DCLK3Q9C098 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DCLK3Q9C098 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DCLK3Q9C098 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DCLK3Q9C098 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DCLK3Q9C098 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCLK3Q9C098 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCLK3Q9C098 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms