Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG6Q9BXT2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG6Q9BXT2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG6Q9BXT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG6Q9BXT2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG6Q9BXT2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNG6Q9BXT2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNG6Q9BXT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNG6Q9BXT2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms