Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCRT1Q9BWW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRT1Q9BWW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRT1Q9BWW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCRT1Q9BWW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRT1Q9BWW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRT1Q9BWW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRT1Q9BWW7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCRT1Q9BWW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCRT1Q9BWW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms