Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP8Q9BV40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP8Q9BV40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP8Q9BV40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VAMP8Q9BV40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VAMP8Q9BV40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAMP8Q9BV40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP8Q9BV40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP8Q9BV40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP8Q9BV40 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP8Q9BV40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP8Q9BV40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP8Q9BV40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP8Q9BV40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms