Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LIMD2Q9BT23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIMD2Q9BT23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD2Q9BT23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIMD2Q9BT23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LIMD2Q9BT23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LIMD2Q9BT23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMD2Q9BT23 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms