Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG101Q9BSB4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG101Q9BSB4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG101Q9BSB4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG101Q9BSB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG101Q9BSB4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG101Q9BSB4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG101Q9BSB4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG101Q9BSB4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG101Q9BSB4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG101Q9BSB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG101Q9BSB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG101Q9BSB4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms