Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELENOSQ9BQE4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELENOSQ9BQE4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOSQ9BQE4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SELENOSQ9BQE4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SELENOSQ9BQE4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELENOSQ9BQE4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELENOSQ9BQE4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SELENOSQ9BQE4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SELENOSQ9BQE4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SELENOSQ9BQE4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SELENOSQ9BQE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SELENOSQ9BQE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SELENOSQ9BQE4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SELENOSQ9BQE4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SELENOSQ9BQE4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms