Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX5

ARPC5L, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5LQ9BPX5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARPC5LQ9BPX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARPC5LQ9BPX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARPC5LQ9BPX5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5LQ9BPX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC5LQ9BPX5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARPC5LQ9BPX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARPC5LQ9BPX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC5LQ9BPX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5LQ9BPX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARPC5LQ9BPX5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC5LQ9BPX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC5LQ9BPX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms