Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARD1Q99728 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BARD1Q99728 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BARD1Q99728 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BARD1Q99728 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BARD1Q99728 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARD1Q99728 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARD1Q99728 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARD1Q99728 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BARD1Q99728 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARD1Q99728 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms