Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPER1Q99527 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPER1Q99527 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPER1Q99527 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPER1Q99527 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPER1Q99527 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPER1Q99527 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPER1Q99527 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPER1Q99527 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPER1Q99527 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms