Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLRE1CQ96SD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLRE1CQ96SD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLRE1CQ96SD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLRE1CQ96SD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLRE1CQ96SD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCLRE1CQ96SD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCLRE1CQ96SD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCLRE1CQ96SD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms