Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H4Q96RI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H4Q96RI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1H4Q96RI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1H4Q96RI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H4Q96RI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1H4Q96RI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1H4Q96RI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H4Q96RI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H4Q96RI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1H4Q96RI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H4Q96RI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1H4Q96RI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1H4Q96RI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR1H4Q96RI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H4Q96RI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H4Q96RI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H4Q96RI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1H4Q96RI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H4Q96RI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H4Q96RI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H4Q96RI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms