Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG1Q96Q15 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG1Q96Q15 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMG1Q96Q15 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG1Q96Q15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG1Q96Q15 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMG1Q96Q15 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMG1Q96Q15 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG1Q96Q15 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG1Q96Q15 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG1Q96Q15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG1Q96Q15 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG1Q96Q15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG1Q96Q15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG1Q96Q15 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG1Q96Q15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG1Q96Q15 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG1Q96Q15 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG1Q96Q15 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG1Q96Q15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG1Q96Q15 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMG1Q96Q15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMG1Q96Q15 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMG1Q96Q15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMG1Q96Q15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
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