Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF3Q96PU9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF3Q96PU9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF3Q96PU9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF3Q96PU9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF3Q96PU9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ODF3Q96PU9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ODF3Q96PU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF3Q96PU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms