Protein–RNA interactions for Protein: Q96P53

WDFY2, WD repeat and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY2Q96P53 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDFY2Q96P53 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
WDFY2Q96P53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDFY2Q96P53 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDFY2Q96P53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDFY2Q96P53 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDFY2Q96P53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDFY2Q96P53 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDFY2Q96P53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDFY2Q96P53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDFY2Q96P53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDFY2Q96P53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDFY2Q96P53 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDFY2Q96P53 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms