Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOVQ96L33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOVQ96L33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOVQ96L33 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOVQ96L33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOVQ96L33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOVQ96L33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOVQ96L33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOVQ96L33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms