Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGSM3Q96HU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM3Q96HU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM3Q96HU1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM3Q96HU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGSM3Q96HU1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGSM3Q96HU1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM3Q96HU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM3Q96HU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM3Q96HU1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGSM3Q96HU1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGSM3Q96HU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM3Q96HU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGSM3Q96HU1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM3Q96HU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms