Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH9

GRAMD2B, GRAM domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2BQ96HH9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRAMD2BQ96HH9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD2BQ96HH9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD2BQ96HH9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD2BQ96HH9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD2BQ96HH9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD2BQ96HH9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRAMD2BQ96HH9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD2BQ96HH9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD2BQ96HH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRAMD2BQ96HH9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRAMD2BQ96HH9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRAMD2BQ96HH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRAMD2BQ96HH9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms