Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFRP2Q96HF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFRP2Q96HF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFRP2Q96HF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFRP2Q96HF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFRP2Q96HF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFRP2Q96HF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFRP2Q96HF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP2Q96HF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFRP2Q96HF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP2Q96HF1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP2Q96HF1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP2Q96HF1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms