Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRELD1Q96HD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRELD1Q96HD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRELD1Q96HD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRELD1Q96HD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRELD1Q96HD1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRELD1Q96HD1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRELD1Q96HD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRELD1Q96HD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CRELD1Q96HD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRELD1Q96HD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CRELD1Q96HD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRELD1Q96HD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRELD1Q96HD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRELD1Q96HD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRELD1Q96HD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRELD1Q96HD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms