Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MISP3Q96FF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MISP3Q96FF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MISP3Q96FF7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MISP3Q96FF7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MISP3Q96FF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MISP3Q96FF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MISP3Q96FF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MISP3Q96FF7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms