Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO17Q96EF6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO17Q96EF6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO17Q96EF6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO17Q96EF6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO17Q96EF6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO17Q96EF6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO17Q96EF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO17Q96EF6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO17Q96EF6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms