Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSI2Q96DH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MSI2Q96DH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSI2Q96DH6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSI2Q96DH6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSI2Q96DH6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSI2Q96DH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSI2Q96DH6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI2Q96DH6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI2Q96DH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms