Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NMD3Q96D46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NMD3Q96D46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NMD3Q96D46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NMD3Q96D46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NMD3Q96D46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NMD3Q96D46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NMD3Q96D46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NMD3Q96D46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NMD3Q96D46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NMD3Q96D46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NMD3Q96D46 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NMD3Q96D46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NMD3Q96D46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NMD3Q96D46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NMD3Q96D46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms