Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C12orf43Q96C57 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C12orf43Q96C57 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf43Q96C57 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf43Q96C57 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C12orf43Q96C57 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C12orf43Q96C57 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C12orf43Q96C57 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C12orf43Q96C57 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C12orf43Q96C57 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf43Q96C57 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C12orf43Q96C57 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C12orf43Q96C57 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C12orf43Q96C57 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf43Q96C57 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf43Q96C57 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf43Q96C57 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C12orf43Q96C57 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf43Q96C57 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C12orf43Q96C57 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf43Q96C57 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf43Q96C57 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C12orf43Q96C57 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf43Q96C57 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms