Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC47Q96A33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC47Q96A33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC47Q96A33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC47Q96A33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC47Q96A33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC47Q96A33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC47Q96A33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC47Q96A33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC47Q96A33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC47Q96A33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC47Q96A33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC47Q96A33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC47Q96A33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC47Q96A33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC47Q96A33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC47Q96A33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC47Q96A33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC47Q96A33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC47Q96A33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms