Protein–RNA interactions for Protein: Q969M1

TOMM40L, Mitochondrial import receptor subunit TOM40B, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40LQ969M1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOMM40LQ969M1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOMM40LQ969M1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOMM40LQ969M1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOMM40LQ969M1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOMM40LQ969M1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOMM40LQ969M1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOMM40LQ969M1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOMM40LQ969M1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOMM40LQ969M1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOMM40LQ969M1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms