Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS1Q92902 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS1Q92902 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS1Q92902 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS1Q92902 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS1Q92902 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS1Q92902 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS1Q92902 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPS1Q92902 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPS1Q92902 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms