Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL2Q92772 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL2Q92772 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDKL2Q92772 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDKL2Q92772 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL2Q92772 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL2Q92772 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL2Q92772 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDKL2Q92772 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDKL2Q92772 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDKL2Q92772 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDKL2Q92772 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDKL2Q92772 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL2Q92772 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL2Q92772 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDKL2Q92772 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDKL2Q92772 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDKL2Q92772 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL2Q92772 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDKL2Q92772 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CDKL2Q92772 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDKL2Q92772 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDKL2Q92772 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL2Q92772 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms