Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPT1BQ92523 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPT1BQ92523 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPT1BQ92523 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPT1BQ92523 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPT1BQ92523 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPT1BQ92523 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPT1BQ92523 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPT1BQ92523 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPT1BQ92523 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPT1BQ92523 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPT1BQ92523 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPT1BQ92523 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPT1BQ92523 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms