Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40AQ8WXH6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB40AQ8WXH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB40AQ8WXH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB40AQ8WXH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB40AQ8WXH6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB40AQ8WXH6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB40AQ8WXH6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB40AQ8WXH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB40AQ8WXH6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB40AQ8WXH6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB40AQ8WXH6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB40AQ8WXH6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB40AQ8WXH6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms