Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSH3Q8TE77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SSH3Q8TE77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH3Q8TE77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH3Q8TE77 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SSH3Q8TE77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SSH3Q8TE77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSH3Q8TE77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SSH3Q8TE77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SSH3Q8TE77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH3Q8TE77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH3Q8TE77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSH3Q8TE77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH3Q8TE77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH3Q8TE77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SSH3Q8TE77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SSH3Q8TE77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSH3Q8TE77 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSH3Q8TE77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SSH3Q8TE77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SSH3Q8TE77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SSH3Q8TE77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SSH3Q8TE77 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms