Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAT3Q8TDW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAT3Q8TDW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAT3Q8TDW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAT3Q8TDW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAT3Q8TDW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAT3Q8TDW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAT3Q8TDW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAT3Q8TDW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAT3Q8TDW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAT3Q8TDW7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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