Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU9

RXFP4, Relaxin-3 receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP4Q8TDU9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RXFP4Q8TDU9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RXFP4Q8TDU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXFP4Q8TDU9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXFP4Q8TDU9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RXFP4Q8TDU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RXFP4Q8TDU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RXFP4Q8TDU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXFP4Q8TDU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXFP4Q8TDU9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXFP4Q8TDU9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RXFP4Q8TDU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RXFP4Q8TDU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXFP4Q8TDU9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXFP4Q8TDU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXFP4Q8TDU9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms