Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD5Q8TDI0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD5Q8TDI0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD5Q8TDI0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD5Q8TDI0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHD5Q8TDI0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHD5Q8TDI0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD5Q8TDI0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD5Q8TDI0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD5Q8TDI0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD5Q8TDI0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHD5Q8TDI0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD5Q8TDI0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms