Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGR3Q8TD06 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGR3Q8TD06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGR3Q8TD06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGR3Q8TD06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
AGR3Q8TD06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGR3Q8TD06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGR3Q8TD06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AGR3Q8TD06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGR3Q8TD06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGR3Q8TD06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGR3Q8TD06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AGR3Q8TD06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGR3Q8TD06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms